3月28日，针对“全国不收费公路将超96%”的消息，新疆维吾尔自治区交通运输厅表示，新疆地处偏远，经济相对落后，最近几年内暂不执行取消二级公路收费政策。同时表示，还没有接到政府还贷二级公路取消收费的通知。

当日，接受记者电话采访的自治区交通运输厅有关负责人表示，根据国务院的改革精神，政府还贷二级公路收费并不是立即取消，而是逐步有序取消。同时，新疆等西部地区因为经济发展落后，如果全部由财政来负责二级公路还贷，压力较大。而东部沿海地区经济发达，相对困难较少。

因此新疆最近几年内都不会执行国家有关逐步有序取消二级公路收费政策。他同时表示，这也是符合国家有关西部大开发政策精神的。

“目前，新疆公路建设正处于大力建设阶段，希望得到社会各界的支持。”这位负责人介绍说，目前新疆公路项目建设面临的最大问题是还债压力。以 2008年为例，全疆应支付公路建设贷款本息49.6亿元，其中本金30亿元、利息19.7亿元，平均每天需支付贷款本息1359万元。

据介绍，到2015年，预计全疆二级公路债务将达500亿元至600亿元。按照中央与地方六四开的比例，新疆将承担200亿元以上债务，偿还还有一定难度。若能争取到中央优惠政策按照七三开或更高的比例，新疆才完全有能力偿还。

政府还贷二级公路即以政府为主体，向银行申请贷款并投资兴建的二级公路，基本不包括通过BOT等模式兴建的私人投资性质公路。